Yakalandığı hastalık nedeniyle İstanbul ve Ankara da bir süre tedavi gören ve daha sonra evinde istirahat eden Fazlıoğlu evinde 06.05.2012 sabaha karşı vefat etti.

Yaşamının büyük bir bölümünü spora adamış ve birçok ünlü sporcunun yetişmesinde emeği olan Fazlıoğlu spor camiasının hocası idi
 
aile Doktoru Yaşar Yılmaz Naci Fazlığlu’nun  kalp yetmezliğinden hayatını kaybettiğini söyledi.
 
Fazlıoğlu’unun cenazesi bugün (06.05.2012)  ikindi namazına müteakip Akyazı Gazisüleymanpaşa camiinde kılınacak cenaze namazı sonrası vasiyeti üzerine . Yuvalak yolu üzerindeki spor tesisine defnedilecek .